解碼院內感染…鮑氏不動桿菌（Acinetobacter baumannii；AB 菌）

台灣團隊解開AB菌全基因體美國家資料庫審核上傳 鉅亨網新聞中心(來源：NOWnews)2012-10-31台灣團隊研究的包氏不動桿菌(AB菌)有成，歷經3年成功將不動桿菌中的一個流行菌株TYTH-1解碼，9月22日拿到美國國家醫學圖書館生物技術資訊中心審核號碼，成為AB基因體為全世界的第11 條。為了要了解細菌抗藥的原因，進而能找到治療的方法，台灣AB團隊於2009年成立，由靜宜大學唐傳義校長召集成立、清華生物資訊分析團隊聯合台大醫院新竹分院郭漢岳醫師團隊、元培科技大學醫學檢驗生物技術系劉明麗教授團隊、與慈濟大學醫技系張凱誌教授、台灣動物科技研究所楊程堯研究員、中華大學生物資訊系劉志俊教授團隊由唐校長率領的靜宜大學與清華大學生物資訊團隊領軍。AB菌因為對環境的適應力很強，常常造成院內的病人交叉感染，前年9月間，日本有一家醫院因此包氏不動桿菌影響，決定將醫院關閉，而TYTH-1 菌株曾經在2008 年於署立新竹醫院（台大醫院新竹分院前身）造成菌血症使病人死亡，為了解答細菌有多重抗生素抗藥性與造成病患死亡的原因，台大分院郭漢岳醫師與林明鋒醫師結合感染控制小組與檢驗科細菌組團隊成員從2005 年開始收集菌株，從臨床資料的收集到細菌身分的鑑定，建立了整套細菌分析的流程。為了要更進一步分析細菌的特性，在當時仍然是台大醫院的前身-行政院衛生署新竹醫院時代，在資源非常有限的情況下，郭醫師團隊成員於2007年結合了元培科技大學劉明麗教授的團隊來做更進一步的菌源分析。台灣AB團隊在這條全基因體創了兩個紀錄 1.基因體拼組的完整性，卓越的資訊演譯技術配合生物實驗室的驗證技術，合作無間，使得基因體拼接完整。2.基因體的註解數量最多，團隊技術已經可以和國際其他的團隊並駕齊驅，可以快速通過美國國家醫學圖書館生物技術資訊中心審核。有了這條基因體，代表已經擁有了非常完整的技術平台，未來可利用此平台技術來解開其他的物種的基因密碼之外，同時可以利用這些基因資訊來尋找細菌產生抗藥性的機制並且進一步找出控制抗藥性菌株傳播的方法，甚至找出能治療疾病的新藥物。此種大突破，將作為包氏不動桿菌基本資料，可用來找出多重抗藥性菌株的抗藥性關鍵位置，以解決當前存在的多重抗藥菌株臨床治療與散布的問題有相當大的幫助。劉教授表示，去年成功的將7株台灣本土菌株解序，命名為TYTH1至TYTH7，TYTH的第一個T代表台灣、Y代表元培、第二個T代表清華、H代表台大新竹分院的前身署立新竹醫院。其實此種研究都是以國家級實驗室所做研究完成，而以靜宜、清華與中華的生物資訊分析團隊與元培科技大學簡易實驗室能夠完成此種研究，真的是很不容易。唐校長的博士班學生謝明峰、呂嘉維、李季青與張君天輪番交棒進行組序與排序的工作，依次交棒給元培科技大學醫學檢驗生物技術系劉明麗教授所帶領的微生物診斷暨醫學分析實驗室團隊、慈濟大學醫技系張凱誌教授、台灣動物科技研究所楊程堯研究員與台大醫院新竹分院郭漢岳醫師團隊進行序列驗證工作，最後交棒給中華大學劉志俊教授進行基因密碼註解與上傳送至美國國家醫學圖書館生物技術資訊中心（The National Center for Biotechnology Information簡稱NCBI）。成為全國第一個以學校實驗室而非國家級實驗室完成細菌體解碼。由於所有的團隊成員緊密的合作與無私的奉獻造就全基因體密碼成功上傳。這條AB基因體為全世界的第11 條,亞洲地區的第5條。目前亞洲有4條分別為台灣衛生署疾病管制局發現的AB菌。大陸天津、杭州的2條，韓國1條。台灣AB團隊去年10月中旬成功的7株台灣本土菌株解序，送入美國國家醫學圖書館生物技術資訊中心。今年即全基因體排出，現TYTH-1成為全世界的代表菌株，再度証明雖無完備設施，但有心及熱忱一樣能完成重要的科學成就。