(CELL) 跳脫型態分類: 利用癌分子群組stemness features 分類腫瘤

治癌大突破 癌症依分子類型治療2018-04-09 〔編譯茅毅／綜合報導〕美國和加拿大學者二○○五年啟動的「癌症基因圖譜（TCGA）」大型研究計畫，近來有新的突破—治療癌症，不該根據它是先在體內哪個部位發現、產生，例如肺、腸或胸部，而是看它屬哪種類型的腫瘤。新的研究認為，卅三種癌症可重新分類為廿八種不同的分子類型或「群組」，在人體的不同部位，這些「群組」中，近三分之二存在分子相似性。北美學者二○○五年啟動的「癌症基因圖譜（TCGA）」大型研究計畫近來發現，卅三種癌症可重新分類為廿八種不同的分子類型或「群組」，有助發展新的療法。美國「聖路易華盛頓大學（Washington University in St. Louis）」醫學院等北美洲廿幾家機構已完成逾一．一萬個腫瘤病例的基因定序與分析，涵蓋卅三種癌症，均屬TCGA計畫一環，旨在追尋癌症基因基礎，增進研究人員對癌症分子機制了解。美國「細胞（Cell）」期刊五日登載與「泛癌症圖譜（PanCancer Atlas）」分析有關的六篇論文。美國國家癌症研究所（NCI）所長柯林斯（Francis Collins）指出，該分析集十幾年來此一開創性研究的大成，讓研究人員前所未有地認識人體如何、在何處及為何形成腫瘤，有助癌症的臨床實驗和今後的治療。

33種癌症重新分為28種類型 TCGA計畫由NCI與美國國家人類基因組研究所（NHGRI）資助，至今共在網路上公開廿九篇論文。新的研究認為，卅三種癌症可重新分類為廿八種不同的分子類型或「群組」，像頭、頸、肺部、食道、膀胱及子宮頸的鱗狀細胞，有很強的分子相似性，可劃歸一類。胃部、結腸和直腸等的癌症屬同一系統，也具有分子相似性。反觀腎癌等部分癌症雖在同一器官發生，卻可能是截然不同的分子亞型。聖路易華盛頓大學醫學助理教授丁莉（Li Ding）說，我們現在清楚了解，驅動癌症的遺傳突變與基因錯誤，隨著年齡增長，會提高癌症發生的風險。加州「巴克老化研究所（Buck Institute for Research on Aging）」教授賓茲（Christopher Benz）提到，重寫癌症教科書時候到了，藉此癌症分類典範轉移機會，打破臨床腫瘤學框架。賓茲認為，TCGA最新研究成果可望有助發展新抗癌療法或讓已獲批准、原先旨在治療其他病症藥物，用於治療癌症。

Cell-of-Origin Patterns Dominate the Molecular Classification of 10,000 Tumors from 33 Types of Cancer (Cell; Volume 173, Issue 2, p291–304.e6, 5 April 2018) We conducted comprehensive integrative molecular analyses of the complete set of tumors in The Cancer Genome Atlas (TCGA), consisting of approximately 10,000 specimens and representing 33 types of cancer. We performed molecular clustering using data on chromosome-arm-level aneuploidy, DNA hypermethylation, mRNA, and miRNA expression levels and reverse-phase protein arrays, of which all, except for aneuploidy, revealed clustering primarily organized by histology, tissue type, or anatomic origin. The influence of cell type was evident in DNA-methylation-based clustering, even after excluding sites with known preexisting tissue-type-specific methylation. Integrative clustering further emphasized the dominant role of cell-of-origin patterns. Molecular similarities among histologically or anatomically related cancer types provide a basis for focused pan-cancer analyses, such as pan-gastrointestinal, pan-gynecological, pan-kidney, and pan-squamous cancers, and those related by stemness features, which in turn may inform strategies for future therapeutic development.